MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 74147

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015731	CAGA	2	8	38	45	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015731	A	6	6	54	59	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015731	TCTTG	2	10	89	98	0 %	60 %	20 %	20 %	339481523
4	NC_015731	A	6	6	107	112	100 %	0 %	0 %	0 %	339481523
5	NC_015731	CAA	2	6	125	130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481523
6	NC_015731	A	6	6	325	330	100 %	0 %	0 %	0 %	339481523
7	NC_015731	TGCAGG	2	12	354	365	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339481523
8	NC_015731	A	8	8	407	414	100 %	0 %	0 %	0 %	339481523
9	NC_015731	GTC	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481523
10	NC_015731	TAC	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481523
11	NC_015731	CGA	2	6	733	738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481523
12	NC_015731	T	6	6	746	751	0 %	100 %	0 %	0 %	339481523
13	NC_015731	TCA	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481523
14	NC_015731	TACC	2	8	838	845	25 %	25 %	0 %	50 %	339481523
15	NC_015731	GAA	2	6	866	871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481523
16	NC_015731	AAAG	2	8	952	959	75 %	0 %	25 %	0 %	339481523
17	NC_015731	A	6	6	969	974	100 %	0 %	0 %	0 %	339481523
18	NC_015731	AAG	2	6	1110	1115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481523
19	NC_015731	GCTG	2	8	1129	1136	0 %	25 %	50 %	25 %	339481523
20	NC_015731	GCC	2	6	1143	1148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481523
21	NC_015731	ATT	2	6	1185	1190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481523
22	NC_015731	A	7	7	1219	1225	100 %	0 %	0 %	0 %	339481523
23	NC_015731	TCG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481523
24	NC_015731	AAC	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015731	CTT	2	6	1461	1466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015731	ACAA	2	8	1524	1531	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015731	TTG	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015731	ATTC	2	8	1555	1562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015731	TAT	2	6	1608	1613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015731	TA	3	6	1619	1624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015731	TTAA	2	8	1632	1639	50 %	50 %	0 %	0 %	339481524
32	NC_015731	GCG	2	6	1694	1699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481524
33	NC_015731	GAA	2	6	1743	1748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481524
34	NC_015731	T	6	6	1757	1762	0 %	100 %	0 %	0 %	339481524
35	NC_015731	TCTT	2	8	1808	1815	0 %	75 %	0 %	25 %	339481524
36	NC_015731	GCA	2	6	1968	1973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481524
37	NC_015731	GTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481524
38	NC_015731	GAA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481524
39	NC_015731	A	6	6	2039	2044	100 %	0 %	0 %	0 %	339481524
40	NC_015731	CAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481524
41	NC_015731	TAT	2	6	2110	2115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481524
42	NC_015731	AGA	2	6	2264	2269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481524
43	NC_015731	ATT	2	6	2514	2519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481524
44	NC_015731	GAA	2	6	2538	2543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481524
45	NC_015731	GAA	3	9	2547	2555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481524
46	NC_015731	TGA	2	6	2573	2578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481524
47	NC_015731	AGC	2	6	2634	2639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481524
48	NC_015731	TGA	2	6	2822	2827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481525
49	NC_015731	GAT	2	6	3025	3030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481525
50	NC_015731	GAT	2	6	3112	3117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481525
51	NC_015731	CTG	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481525
52	NC_015731	TGA	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481525
53	NC_015731	CGG	2	6	3162	3167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481525
54	NC_015731	CGA	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481525
55	NC_015731	CGG	2	6	3198	3203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481525
56	NC_015731	GGT	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481525
57	NC_015731	CCG	2	6	3264	3269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481525
58	NC_015731	AGCG	2	8	3340	3347	25 %	0 %	50 %	25 %	339481525
59	NC_015731	CAA	2	6	3450	3455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481525
60	NC_015731	CGG	2	6	3516	3521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481525
61	NC_015731	TTG	2	6	3533	3538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481525
62	NC_015731	GCA	2	6	3551	3556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481525
63	NC_015731	T	6	6	3578	3583	0 %	100 %	0 %	0 %	339481525
64	NC_015731	ACA	2	6	3602	3607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481525
65	NC_015731	CAA	2	6	3669	3674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481525
66	NC_015731	TGC	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481525
67	NC_015731	AAC	2	6	3739	3744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481525
68	NC_015731	A	7	7	3752	3758	100 %	0 %	0 %	0 %	339481525
69	NC_015731	A	6	6	3769	3774	100 %	0 %	0 %	0 %	339481525
70	NC_015731	GT	3	6	3819	3824	0 %	50 %	50 %	0 %	339481525
71	NC_015731	TCC	2	6	3883	3888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339481525
72	NC_015731	GGT	2	6	3900	3905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481525
73	NC_015731	GAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481525
74	NC_015731	GCC	2	6	3991	3996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481525
75	NC_015731	GCG	2	6	4009	4014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481525
76	NC_015731	CAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481525
77	NC_015731	TCC	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339481525
78	NC_015731	ATT	2	6	4258	4263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481525
79	NC_015731	CAT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481525
80	NC_015731	CTT	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481525
81	NC_015731	A	6	6	4480	4485	100 %	0 %	0 %	0 %	339481525
82	NC_015731	ACA	2	6	4518	4523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481525
83	NC_015731	GAA	2	6	4567	4572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481525
84	NC_015731	GCC	2	6	4575	4580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481525
85	NC_015731	AC	3	6	4592	4597	50 %	0 %	0 %	50 %	339481525
86	NC_015731	A	6	6	4601	4606	100 %	0 %	0 %	0 %	339481525
87	NC_015731	AT	3	6	4617	4622	50 %	50 %	0 %	0 %	339481525
88	NC_015731	ATGC	2	8	4675	4682	25 %	25 %	25 %	25 %	339481525
89	NC_015731	CTG	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481525
90	NC_015731	AGC	2	6	4711	4716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481525
91	NC_015731	TCG	2	6	4775	4780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481525
92	NC_015731	ATG	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481525
93	NC_015731	GCG	2	6	4880	4885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481525
94	NC_015731	TACA	2	8	4945	4952	50 %	25 %	0 %	25 %	339481525
95	NC_015731	GAA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481525
96	NC_015731	A	6	6	5020	5025	100 %	0 %	0 %	0 %	339481525
97	NC_015731	ACC	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481525
98	NC_015731	CCG	2	6	5106	5111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481525
99	NC_015731	CTG	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481525
100	NC_015731	TGA	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481525
101	NC_015731	TAC	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481525
102	NC_015731	GC	3	6	5193	5198	0 %	0 %	50 %	50 %	339481525
103	NC_015731	GAA	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481525
104	NC_015731	CGA	2	6	5225	5230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481525
105	NC_015731	A	6	6	5258	5263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015731	A	6	6	5295	5300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015731	AG	3	6	5356	5361	50 %	0 %	50 %	0 %	339481526
108	NC_015731	GCT	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
109	NC_015731	GCA	2	6	5434	5439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
110	NC_015731	GGC	2	6	5440	5445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481526
111	NC_015731	AGC	2	6	5511	5516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
112	NC_015731	GCC	3	9	5627	5635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481526
113	NC_015731	GCAA	2	8	5666	5673	50 %	0 %	25 %	25 %	339481526
114	NC_015731	ACGA	2	8	5824	5831	50 %	0 %	25 %	25 %	339481526
115	NC_015731	CGA	2	6	5865	5870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
116	NC_015731	AGG	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339481526
117	NC_015731	GAT	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481526
118	NC_015731	TCG	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
119	NC_015731	TTG	2	6	6233	6238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481526
120	NC_015731	GCG	2	6	6249	6254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481526
121	NC_015731	CTG	2	6	6316	6321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
122	NC_015731	CGT	2	6	6323	6328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
123	NC_015731	GAT	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481526
124	NC_015731	CCG	2	6	6455	6460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481526
125	NC_015731	CAT	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481526
126	NC_015731	GGC	2	6	6561	6566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481526
127	NC_015731	CTG	2	6	6598	6603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
128	NC_015731	ATC	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481526
129	NC_015731	CG	3	6	6769	6774	0 %	0 %	50 %	50 %	339481526
130	NC_015731	AGC	2	6	6800	6805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
131	NC_015731	ACCG	2	8	6814	6821	25 %	0 %	25 %	50 %	339481526
132	NC_015731	AGC	2	6	6852	6857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
133	NC_015731	GC	3	6	6877	6882	0 %	0 %	50 %	50 %	339481526
134	NC_015731	TGA	2	6	6890	6895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481526
135	NC_015731	TCA	2	6	6947	6952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481526
136	NC_015731	CGTGGT	2	12	7029	7040	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339481526
137	NC_015731	GCA	2	6	7055	7060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
138	NC_015731	CTG	2	6	7087	7092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
139	NC_015731	CGA	2	6	7134	7139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
140	NC_015731	GCG	2	6	7176	7181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481526
141	NC_015731	TGCGCG	2	12	7337	7348	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339481526
142	NC_015731	GCCGC	2	10	7358	7367	0 %	0 %	40 %	60 %	339481526
143	NC_015731	CGA	2	6	7434	7439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481526
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145	NC_015731	CCG	2	6	7524	7529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481526
146	NC_015731	GCTG	2	8	7566	7573	0 %	25 %	50 %	25 %	339481526
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148	NC_015731	AAGCA	2	10	7651	7660	60 %	0 %	20 %	20 %	339481526
149	NC_015731	GGCT	2	8	7687	7694	0 %	25 %	50 %	25 %	339481526
150	NC_015731	TGG	2	6	7745	7750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481526
151	NC_015731	AGA	2	6	7785	7790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481526
152	NC_015731	GCT	3	9	7803	7811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
153	NC_015731	GCT	2	6	7896	7901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481526
154	NC_015731	ATCA	2	8	7909	7916	50 %	25 %	0 %	25 %	339481526
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158	NC_015731	CCA	2	6	8325	8330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481527
159	NC_015731	CTG	2	6	8350	8355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481527
160	NC_015731	CAG	2	6	8361	8366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481527
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162	NC_015731	CCA	2	6	8424	8429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481527
163	NC_015731	AAG	2	6	8431	8436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481527
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168	NC_015731	AAG	2	6	8733	8738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481527
169	NC_015731	TTC	2	6	8740	8745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481527
170	NC_015731	ACT	2	6	8750	8755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481527
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247	NC_015731	CAT	2	6	12325	12330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481530
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249	NC_015731	GGC	2	6	12368	12373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481530
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251	NC_015731	CTA	2	6	12415	12420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481530
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254	NC_015731	CGAG	2	8	12573	12580	25 %	0 %	50 %	25 %	339481530
255	NC_015731	CAC	2	6	12598	12603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481530
256	NC_015731	CCG	2	6	12615	12620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481530
257	NC_015731	CGG	2	6	12649	12654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481530
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261	NC_015731	GAA	2	6	12739	12744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481530
262	NC_015731	GC	3	6	12764	12769	0 %	0 %	50 %	50 %	339481530
263	NC_015731	GGA	2	6	12858	12863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339481530
264	NC_015731	TTTG	2	8	12892	12899	0 %	75 %	25 %	0 %	339481530
265	NC_015731	TGG	2	6	12904	12909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481530
266	NC_015731	GGA	2	6	12910	12915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339481530
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387	NC_015731	CAAAT	2	10	19461	19470	60 %	20 %	0 %	20 %	339481534
388	NC_015731	CCGG	2	8	19502	19509	0 %	0 %	50 %	50 %	339481534
389	NC_015731	T	6	6	19557	19562	0 %	100 %	0 %	0 %	339481534
390	NC_015731	CCA	2	6	19625	19630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481534
391	NC_015731	CGC	2	6	19652	19657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481534
392	NC_015731	CGA	2	6	19682	19687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481534
393	NC_015731	GAT	2	6	19869	19874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481534
394	NC_015731	ATAA	2	8	19900	19907	75 %	25 %	0 %	0 %	339481534
395	NC_015731	GTT	2	6	19929	19934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
396	NC_015731	ACTG	2	8	19957	19964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
397	NC_015731	ATT	2	6	19984	19989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_015731	T	6	6	20122	20127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_015731	TGG	2	6	20153	20158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
400	NC_015731	TGT	2	6	20199	20204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
401	NC_015731	AAT	2	6	20268	20273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481535
402	NC_015731	AAT	2	6	20278	20283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481535
403	NC_015731	ATG	2	6	20308	20313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481535
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421	NC_015731	T	8	8	20973	20980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_015731	GGC	2	6	21195	21200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481537
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425	NC_015731	GCA	3	9	21294	21302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481537
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428	NC_015731	ACC	2	6	21423	21428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481537
429	NC_015731	ATA	2	6	21436	21441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_015731	GCC	2	6	21595	21600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481538
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453	NC_015731	T	6	6	22712	22717	0 %	100 %	0 %	0 %	339481538
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484	NC_015731	AT	3	6	24098	24103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_015731	GTG	2	6	24115	24120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
486	NC_015731	AAT	2	6	24178	24183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_015731	TCA	2	6	24193	24198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
488	NC_015731	GAA	2	6	24210	24215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
489	NC_015731	CAA	2	6	24249	24254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
490	NC_015731	CTG	2	6	24275	24280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
491	NC_015731	TGAT	2	8	24372	24379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
492	NC_015731	TGC	2	6	24390	24395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
493	NC_015731	TCA	2	6	24415	24420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
494	NC_015731	TCG	2	6	24424	24429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
495	NC_015731	T	7	7	24474	24480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_015731	GGAAT	2	10	24552	24561	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
497	NC_015731	TAC	2	6	24605	24610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
498	NC_015731	TACC	2	8	24628	24635	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
499	NC_015731	TTC	2	6	24787	24792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481540
500	NC_015731	ATT	2	6	24796	24801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481540

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